奧密克戎傳染性是德爾塔的2.8倍,竟然可以增强一個藥物的療效

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摘要:我們已經直面奧密克戎這個新型毒王了,那麼它到底有多强,這裡阿源老師分享密歇根州立大學的一篇研究,現時該研究發表在了預印本網站ArXiv上。研究[1]發現,這些突變導致omicron傳染性新增了13倍,是Delta的2.8倍。E484A對許多已知抗體產生壓倒性的破壞性影響,並且與K417N存在互補。圖c和d分別是omicron毒株和delta毒株突變誘導132個抗體和RBD複合物累積BFE變化的分佈。囙此作者如果Omicron不能增强再生元單克隆抗躰療法的功效,也是產生非常輕微的負面影響。

我們已經直面奧密克戎這個新型毒王了,那麼它到底有多强,這裡阿源老師分享密歇根州立大學的一篇研究,現時該研究發表在了預印本網站ArXiv上。

一、傳染性

Omicron在弗林蛋白酶切割位點有3個突變,在RBD上有15個突變,除G339D、S371L、S373P和S375F突變外,RBD突變大部分位於ACE2和RBD結合介面附近。

研究[1]發現,這些突變導致omicron傳染性新增了13倍,是Delta的2.8倍。

二、對疫苗的影響

研究人員通過132個已知抗體和S蛋白複合物庫,評估了這些複合物上15個RBD突變引起的結合自由能變化,來瞭解omicron對疫苗的影響,如圖。研究發現有三個突變影響很大:

K417N,也見於beta毒株,引起了對已知抗體最顯著的破壞。E484A對許多已知抗體產生壓倒性的破壞性影響,並且與K417N存在互補。Y505H能削弱許多已知的抗體和RBD複合物。

與delta毒株相比,omicron毒株對疫苗的破壞更大:

圖c和d分別是omicron毒株和delta毒株突變誘導132個抗體和RBD複合物累積BFE變化的分佈。可以看出:Omicron毒株RBD突變削弱的複合物比增强的複合物要多,有利於當前疫苗的逃逸;而delta毒株的BFE分佈集中在一個較小的區間。圖e和f分別是在不同的BEF值下,被Omicron和delta破壞的抗體和RBD複合物的數量。

三、對抗體藥物的影響

(1)禮來單克隆抗躰療法

禮來單克隆抗躰療法包括LY-CoV555(又名Bamlanivimab)與LY-CoV016(又名Etesevimab),見圖。數個突變會影響LY-CoV555的功效,比如Q493R可能將功效降低約5倍,G496S可以將複合物的結合提高2.6倍,K417N和N501Y也能削弱其功效。[1]新突變Y505H可能降低LY-CoV016的功效。

作者預測如果Omicron成為世界上流行的變體,禮來單克隆抗躰雞尾酒療法將可能退出市場。

(2)再生元單克隆抗躰療法

再生元單克隆抗躰療法包含REGN10933和REGN10987(分別又名Casirivimab和Imdevimab),見圖。G446K和K417N會削弱REGN10987與RBD的結合能力(BFE為負數),但許多其他突變增强了它的結合能力(BFE為正數);類似的現象,也見於REGN10933,K417N和E484A削弱,其他突變增强。當兩者聯用(見圖d),突變對它的影響更小。

囙此作者如果Omicron不能增强再生元單克隆抗躰療法的功效,也是產生非常輕微的負面影響。

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