27日上午，東航墜機事故現場搜救人員發現MU5735班機的飛行數據記錄器（第二部黑匣子）。至此，失事飛機兩部黑匣子均已找到。

27日在“3·21”東航MU5735航空器飛行事故國家應急處置指揮部第八場新聞發佈會上，民航局航空安全辦公室主任朱濤介紹，27日9時20分左右，消防救援人員在科技組指定的重點區域深度搜尋，人工挖掘出一橙色圓柱狀物體，現場勘查的民航事故調查人員確認為第二部黑匣子。

朱濤介紹，第二部黑匣子發現地點為事故現場撞擊點東側山坡距主要撞擊點約40米、地表約1.5米土層下，現時該記錄器已送往專業實驗室進行解碼工作。

民航局事故調查中心主任毛延峰介紹，飛行數據記錄器中的數據能够為事故原因分析提供真實、客觀的證據。後期，調查人員需要把兩部記錄器的數據，以及現場勘查的證據、空管雷達數據、機組和空管組織的陸空通話、飛機與地面的資料鏈傳輸資訊、證人訪談等資訊結合起來，進行綜合分析研判，才能更加客觀準確地分析事故的原因。

27日，記者在搜救現場看到，幾臺大型怪手正在工作，工作人員穿著防護服、佩戴口罩，在進行後續的搜尋取證工作。毛延峰說，現場調查工作結束後，調查組將綜合前期調查中獲取的所有資訊和數據，結合實驗驗證結論，進行充分分析和研判，揭示事故發生的原因。

21日，東方航空MU5735班機執行昆明—廣州任務時，在廣西梧州藤縣上空失聯並墜毀，機上載有乘客123人、機組人員9人。26日晚“3·21”東航MU5735航空器飛行事故國家應急處置指揮部確認，東航MU5735班機機上人員全部遇難。