1925年3月12日，59歲的孫中山先生在北京病逝，孫中山先生生前希望把自己的遺體保留下來，以供人們瞻仰，入殮之前，由北京協和醫院對遺體做了防腐處理，力求保存完好。

蘇聯方面在得知孫中山先生病逝後，也隨即送來了一口水晶棺，用來安放遺體，不過由於路程原因，水晶棺送來時遺體已經入殮，只能暫時存放以待再用。

按照孫中山生前叮囑，死後要葬在南京的紫金山，病逝在北京屬於突發事件，南京的墓地還沒有建好，只能是先放在北京，於是孫中山的遺體存放在北京的碧雲寺。

由孫中山生前的侍衛守護，這些人都是忠心耿耿的侍衛，另一頭，南京方面的喪事籌備會正在徵集陵墓的設計方案，通過海選的管道進行，最終“自由鐘”的設計方案被採用。

有了設計方案，緊接著就是動工修建，原本計畫是用14個月的時間修建完成，可是由於戰爭等原因，工程的進展受到了影響，一直到1929年3月，主體工程才算完工。

而在碧雲寺裡面，保護孫中山先生遺體期間還出現了一件大事，那是在1926年，也就是陵墓修建的第二年，革命軍把大軍閥張宗昌打的打敗，張宗昌逃往北平躲避。

戰敗的張宗昌很是窩火，這股是要泄掉才行，於是張宗昌想起了碧雲寺裏孫中山的遺體，張宗昌揚言要派兵去燒了孫中山的遺體，守護的衛士都擔心不已，畢竟看守的人少。

於是衛士們匆忙對孫中山遺體進行轉移，藏到了碧雲寺附近的一個山洞裏，就這樣才躲過一劫，後來證實，張宗昌確實去了碧雲寺，沒有找到遺體才作罷的，實在太險了。

遺憾的是，避開了軍閥張宗昌的破壞，卻沒有避開腐壞，由於轉移過程中導致防腐效果變差，遺體有的已經出現了黑色，再加上陵墓的主體過程一直到1929年才算完成。

這樣一來遺體存放的時間太長了，1929年4月23日，何應欽被派往北京，擔任迎接靈柩的總指揮，5月26日，靈柩從北平南下到南京，用了3天時間，於28日抵達南京。

隨後停靈3天，以供各界人士進行祭奠活動，按理說在換棺椁的時候可以換入水晶棺之中，不過由於防腐效果不理想，已經難以供人瞻仰了，只好採用封墓的管道進行安葬。

6月1日這天，孫中山先的靈柩被送入墓室，墓室外用鋼筋水泥密封的十分嚴實，尋常手段是打不開的，如今中山陵已經成為了一大旅遊勝地，去南京玩的人，都會去看看中山陵。