西元1626年，努爾哈赤死於瀋陽城外40公里處。得知這一消息後，袁崇煥立即上書朝廷：“敵酋努爾哈赤因耻於寧遠大敗，毒疽病發而亡。”朝鮮人卻說：“敵酋是被明軍炮擊，負傷而亡。”

西元1626年正月，努爾哈赤率領六萬後金大軍，對明軍發起了進攻。誰也沒有想到，已經68歲的努爾哈赤竟然連克8城，並且絲毫沒有見好就收的打算，直到來到寧遠城下，遇到了命中的那個他（袁崇煥），才被擊敗。兵敗回兵瀋陽的努爾哈赤，沒有多久就撒手人寰。

努爾哈赤的突然離世，留給了子孫後代未竟的大業，同時也給了後人留下了許多不解之謎。關於努爾哈赤死亡的真實原因，史學界爭論不休，一直沒有定論。爭論的焦點主要集中在：是炮擊負傷而亡？還是患毒疽而死？

根據《清太祖武皇帝實錄》記載：“天命十一年七月二十三日，努爾哈赤感到身體不適，於是前往清河泡溫泉療養，沒想到月末卻更加嚴重了。他乘舟回京（盛京），派人請大妃前來迎接，兩人在渾河相遇。在離瀋陽四十裏的[插圖]雞堡，努爾哈赤駕崩。”

也就是說，正史記載努爾哈赤是在1626年的月份忽然感覺身體不舒服，前後不過一個禮拜就駕崩了。究竟什麼病，病發一個多禮拜就去世，清正史記錄不詳，似乎也有意掩蓋什麼。

而根據《明熹宗實錄》的記載，袁崇煥認為努爾哈赤寧遠兵敗後憤懣抑鬱，患背疽而死。明朝人沈國元的《兩朝從信錄》也是同樣的記載。

看來努爾哈赤的死因已經確定，就是毒疽病發而亡。但是朝鮮人李星齡著的《春坡堂日月錄》中卻不是這樣記載。書中記載，朝鮮一個翻譯人員韓瑗受到袁崇煥的器重，跟在袁崇煥身邊目睹了整個寧遠之戰的全過程。

據這名翻譯人員回憶，努爾哈赤率兵來到寧遠城下後，公然讓袁崇煥投降。袁崇煥為了鼓舞明軍士氣，在城樓上佈置了11門採購自英國的紅夷大炮。戰爭一開始，沒有見識過火器的後金阿兵哥，當即死亡無數。

至於努爾哈赤是否有被炮擊傷？韓璦是這麼說的，“努爾哈赤先已重傷”，在後金軍隊撤後“因憤懣而斃”，還說戰後袁崇煥有故意派人探望努爾哈赤，名為送禮，實測言語譏諷，“老將軍橫行天下那麼多年，今天卻敗在我這個名不見經傳的小將手上。看來，這就是天書啊！”努爾哈赤聽完氣急攻心，不久便傳出死訊。

不過這種說法也遭到了許多學者的質疑，似乎也站不住脚，理由有三：

首先，如果努爾哈赤真的是被明軍的紅夷大炮所傷，不治而亡，這麼大的功勞，袁崇煥和其他明軍將領在給朝廷上奏的寧遠大捷戰報中，為何隻字未提努爾哈赤受傷之事？

事實上袁崇煥給朝廷的上書中是這麼描述的：“前後傷虜數千，內有頭目數人，酋子一人”只說了擊傷敵人頭目數人，沒有提及是何身份。

其次，從寧遠之戰結束到努爾哈赤去世，中間間隔了近8個月，這麼長的時間如果遍尋名醫都沒有治好傷勢也可以理解。但是根據清史的記載，在這8個月內，努爾哈赤可沒有閑著，在同年四月分的時候，他還率領後金大軍攻打蒙古喀爾喀部，直到五月上旬才返回瀋陽。如果真的在寧遠大戰中重傷了，不可能還如此活蹦亂跳到處蹦躂。

最後，現時已知的史料中，只有這本朝鮮人李星齡著的《春坡堂日月錄》中是如此記載，沒有其他佐證能够證明其真實性，就連朝鮮人自己的其他史書中也記載：“奴酋七月得肉毒病，沐浴於遼東溫泉，而病勢漸重，回向瀋陽之際，中路而斃”。

努爾哈赤雖然年僅68歲就去世了，但是他為後世清軍同明軍作戰，並逐鹿中原提供了基礎。對於他的真實死因，公說公有理，婆說婆有理，現在已經不可考校。但秉著懷疑的態度，我們不能人云亦云，只能客觀地分析可能的原因。