中國近代史是從1840年6月鴉片戰爭爆發開始，不斷受到西方列强的殖民威脅，而我們今天要說的是這一時期最偉大的平亂之戰！

阿古柏之亂，源於1864年，新疆民亂，庫車、和闐、喀什、吐魯番等地先後建立了地方割據政權，與清兵互相攻伐，局勢混亂。佔據喀什舊城的思的克自立為“帕夏”，為了樹立威信，决定派手下金相印去浩罕城迎回大和卓曾孫布素魯克，立為傀儡。1865年春，浩罕國阿力木庫爾汗派阿古柏率領50名騎兵護送布素魯克去喀什。一到喀什，布素魯克和阿古柏便組織兵變，將思的克逐出喀什。1864年4月11日攻克英吉沙，並將司迪爾殘部徹底逐出新疆。在阿古柏扶持下，布素魯克於1865年4月建立了“哲德沙爾汗國”，意即“七城汗國”，表明一統回部七大城的野心。1867年，浩罕被俄國支持的布哈拉汗國再次戰敗，遺失塔什干，約7000名殘部在玉努斯江率領下逃入新疆投奔同族阿古柏。得到這支生力軍的阿古柏實力大增，連克葉爾羌、和闐。就在此時，布素魯克在喀什發動兵變，希望擺脫阿古柏，堅守41天后失敗，阿古柏政變，把布素魯克逼下寶座，送去阿拉伯半島麥加朝聖。阿古柏立波羅尼都之子薩木克長子玉素甫的之子，亦是布素魯克的堂兄買買提明即位，號稱“卡塔條勒”。第二年，由於卡塔條勒也不安心做傀儡，故當傀儡還不到4個月就被阿古柏暗中毒死。同時，經過反復爭奪，阿古柏終於擊敗了熱西丁，奪取了阿克蘇，統一了除庫車之外的南疆。

1867年5月，隨著阿古柏的不斷勝利，他覺得不再需要傀儡了，於是他宣佈取消“哲德沙爾汗國”，建立“洪福汗國”，沙俄亦趁機於1871年7月侵佔伊犁。1868年，英國派遣特使會晤阿古柏，承認其政權，次年，阿古柏也派親信米爾紮·沙迪赴印度會見英國總督，爭取英國支持。英國决定向其贈送大批軍火，並允許其在印度招募工匠回喀什設立軍工廠。1870年，俄國也派人前往喀什會晤阿古柏，承認其政權。不過總體來說，在這一時期，英國仍然是阿古柏的主要支持者，期望能够通過支援阿古柏將俄國的擴張封锁在天山以北。

1875年5月，清廷下詔授左宗棠以欽差大臣督辦新疆軍務，全權節制三軍，以將軍金順為幫辦軍務，擇機出塞平叛新疆。1876年4月，左宗棠在肅州祭旗，正式出兵。左宗棠坐鎮肅州，命劉錦棠、金順分兵兩路，先後率師出關。考慮到飲水困難，他把大軍分作千人一隊，隔日進發一隊，劉錦棠走北路，金順走南路，到哈密會齊。劉錦棠率領西征軍主力自肅州入新，至哈密行程約1700裏，很順利地進入哈密。部隊各營到達哈密後，把從肅州等地陸續運往哈密的軍糧再輾轉搬運，翻過東天山九曲險道，分運至巴里坤和古城。很快，劉錦棠的前鋒部隊，佔據了距離烏魯木齊只有不足三百裏的濟木薩（今吉木薩爾縣）。8月，劉、金兩軍協力，經激戰攻下烏魯木齊週邊的古牧地；阿古柏的幫兇白彥虎、馬人得弃烏魯木齊而逃，劉錦棠遂兵不血刃收復烏城。隨後，金順進占昌吉，榮全在劉錦棠協助下攻克瑪納斯城。至此，北路蕩平。1877年4月，劉錦棠出兵，迅速收復達阪城和托克遜城；徐占彪與張曜在鹽池會師，攻克吐魯番門戶七克騰木。阿古柏逃往焉耆，留其幼子駐守庫爾勒為其墊後。不久，劉、張、徐三軍合擊，又收復吐魯番。阿古柏一看通往南路的門戶打開，自知大勢已去，乃服毒自殺（一說被毒殺）。阿古柏的長子胡裡為爭權奪比特殺死其弟，率領殘部逃往喀什。白彥虎率領餘眾逃竄到開都河一帶。清軍收復新疆過程中，英使威妥瑪多次對清廷展開恫嚇，此時又勸清廷停止進軍、將阿古柏勢力認作藩屬，海防派亦運作朝廷，清廷遂向左宗棠說明，“廷臣聚議，西征耗費鉅款，今烏城、吐魯番既得，可以休兵”，並讓左宗棠“統籌全域”，提出己見。左宗棠上疏據理力爭，強調新疆的戰畧意義、當前的大好形勢，並提出要在新疆實行省制，最後得以繼續新疆收復戰。

同年8月，大軍從正道向西挺進，先收復南疆東四城（喀喇沙爾、庫車、阿克蘇、烏什）。10月間，西征軍先後收復喀喇沙爾、庫車、庫爾勒、拜城、阿克蘇、烏什，白彥虎一路西逃並劫掠秋糧。東四城既克，西四城之敵自亂陣腳，相互攻殺。12月間，劉錦棠進軍，先後收復喀什噶爾、葉爾羌、英吉沙爾，阿古柏的長子胡裡與白彥虎逃往俄國。1878年1月2日，和田克複。至此，這場由英、俄兩國支持的阿古柏之亂乃告平息。見此情景，住在山中的布魯特十四個部落，爭相內附。僅一年多時間，左宗棠就指揮西征軍，收復了除伊犁以外的新疆領土。清廷嘉其功，詔封二等恪靖侯。新疆各地也於大小村鎮建立左公祠，燒香禮拜。後又經多次談叛於1882年，沙俄正式交還伊犁，左宗棠第五次向清朝政府奏請新疆建省，左宗棠懇切陳詞說服了清朝政府，同意著手在新疆建省。經過籌畫，1884年，新疆省正式建立。